Son líneas de actuación y servicios propios de la FELGTBI+ el servicio de atención y apoyo a jóvenes y familias LGTBI Línea ArcoIris, el servicio de asesoramiento laboral, la coordinación de políticas de intervención en centros educativos de infantil, primaria y secundaria, el liderazgo de “Redes contra el Odio”, el Observatorio Estatal de delitos de odio por motivo de orientación sexual, identidad y expresión de género, y la coordinación de diferentes programas de prevención, intervención y reducción de daños en materia de VIH.
Actualmente, uno de los mayores retos a los que se enfrenta la FELGTBI+ es conseguir la aprobación por parte del Gobierno la conocida como estatal Ley de Igualdad LGTBI.